Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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