Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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