Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms