Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms