Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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