Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CCC3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CCC3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CCC3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms