Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms