Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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H2-M10.4Q85ZW8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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H2-M10.4Q85ZW8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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H2-M10.4Q85ZW8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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H2-M10.4Q85ZW8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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H2-M10.4Q85ZW8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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