Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf7ipQ7TT18 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms