Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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