Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms