Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms