Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms