Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Zbtb40Q6PCS8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Zbtb40Q6PCS8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms