Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms