Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms