Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ParpbpQ6IRT3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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