Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms