Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms