Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg9aQ68FE2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms