Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kiaa1549Q68FD9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kiaa1549Q68FD9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms