Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.1 ms