Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5dQ62240 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms