Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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