Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HellsQ60848 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms