Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfrsf8Q60846 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf8Q60846 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms