Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Trim38Q5SZ99 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim38Q5SZ99 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim38Q5SZ99 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim38Q5SZ99 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim38Q5SZ99 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim38Q5SZ99 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim38Q5SZ99 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim38Q5SZ99 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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