Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms