Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms