Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ecm2Q5FW85 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms