Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shank3Q4ACU6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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