Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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