Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms