Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc27Q3V036 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms