Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5460Q3UQ97 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5460Q3UQ97 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms