Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms