Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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