Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms