Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Q3U6N9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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