Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Kdm4dQ3U2K5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms