Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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