Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms