Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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