Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms