Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp444Q3TDV8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp444Q3TDV8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms