Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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