Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tmprss11cQ1JRP2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tmprss11cQ1JRP2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tmprss11cQ1JRP2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tmprss11cQ1JRP2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tmprss11cQ1JRP2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tmprss11cQ1JRP2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmprss11cQ1JRP2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Tmprss11cQ1JRP2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tmprss11cQ1JRP2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tmprss11cQ1JRP2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmprss11cQ1JRP2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms