Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms