Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itgb8Q0VBD0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms