Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms